История центра ведет отсчет с 1960 года, когда в городе Острове Псковской области была сформирована 44-я учебная воздушно-десантная дивизия. В нее вошли 78-й отдельный учебный самоходно-артиллерийский батальон, 17-й учебный центр ВДВ и 11-я школа младших специалистов медицинской службы. В 1961-м дивизия была переведена в город Каунас (п. Гайжюнай) Прибалтийского военного округа, в 1987 году переименована в 242-й учебный центр ВДВ, а в 1993-м центр был выведен на территорию Российской Федерации в город Омск. За свою долгую историю центр подготовил более 264 тысяч специалистов.